在保税区发生退运却遭遇不能清关的情况时，需全面了解相关细节以妥善解决。首先是价格方面，其受多种因素影响。若因单证缺失导致不能清关，补充单证的资料整理等费用一般单次在数千元至万元左右，若涉及货物检测，检测费用另计，若退运货物价值较高，整体费用可能相应增加。

接着是流程部分。第一步，企业要向海关提交退运不能清关的书面说明，详细阐述退运缘由及当前不能清关的具体状况。第二步，海关会根据说明要求企业补充缺失或不完善的资料，企业需按照海关指引迅速整理并提交。第三步，海关对补充的资料进行审核，审核通过后，企业再重新按照正常退运清关流程办理手续，此流程时长因资料补充效率和海关审核速度而异，短则几个工作日，长则数周。

而所需资料也有明确要求。基本资料包括原出口合同、原出口发票、退运协议、报关单等。若因质量问题退运，需提供专业机构出具的质量检测报告；若是包装不符合规定，要提供重新包装的方案及相关证明文件。企业务必保证资料真实完整，否则会延缓清关进程。

企业在面对保税区退运不能清关时，需清晰知晓价格构成、熟悉操作流程并准备齐全资料，如此才能高效解决不能清关问题，保障退运业务顺利推进。