多式联运在物流领域有其优势，但也存在一些明显缺点。首先是价格方面，多式联运整合了公路、铁路、海运、空运等多种运输方式，不同运输方式的成本叠加使得整体价格可能较高。因为每种运输方式都有其自身的收费标准，比如海运有海运运费、港口装卸费等，铁路运输有铁路运费、站台费用等，公路运输有车辆运输费、过路费等，多种费用相加，相比单一运输方式，价格往往没有优势，对于一些对成本敏感的货物运输来说，这可能是一个阻碍。

其次是流程复杂。多式联运需要协调不同运输主体之间的衔接。从起运地的货物收集，到不同运输方式的转换，比如先公路运输到港口，再转海运，然后到达目的地后又要转铁路或公路运输到最终收货点。在这个过程中，任何一个环节出现问题都会影响整个流程。例如，公路运输可能因为交通拥堵导致货物到达港口延迟，进而影响海运的船期安排，海运到达目的港后，若港口装卸出现故障又会耽误后续的铁路或公路运输，整个流程的复杂性增加了运输延误和出现差错的风险。

再者是资料方面。多式联运涉及多种运输方式，需要准备大量不同的资料。比如海运需要提单、报关单等，公路运输需要运输合同、运单等，铁路运输需要铁路运单等。不同运输方式对资料的格式、内容等要求不同，托运人需要准确准备各种资料，稍有疏忽就可能出现资料缺失或不符合要求的情况。例如，报关资料不符合海关规定，就会导致货物在通关环节受阻，延误运输时间，增加额外的沟通和修改资料的成本。

此外，多式联运对物流企业的综合协调能力要求很高。企业需要具备整合多种运输资源的能力，包括与不同运输公司、港口、机场等的合作协调。如果企业的协调能力不足，就容易出现各环节衔接不畅的问题，进一步放大了价格、流程、资料等方面带来的不利影响。而且，多式联运的责任界定相对复杂，在不同运输方式转换过程中，一旦发生货物损坏、丢失等情况，很难明确具体是哪种运输方式的责任，增加了纠纷解决的难度和成本。多式联运虽然有其独特优势，但在价格、流程、资料等方面存在较多实际需求需要应对的缺点。